本发明公开了一种基于引导滤波和高通滤波的红外图像非均匀性校正方法，将带有非均匀性的原始图像序列第一帧图像的高频成分赋值为第一个固定图案噪声f1；依次载入带有非均匀性的原始图像序列中第N帧图像作为当前帧图像，确定当前帧图像和第N‑1帧图像的差值获得第N‑1帧差值图像，根据第N‑1帧差值图像获得所述第N‑1帧图像每个像元的相对变化幅度；结合当前帧图像的高频成分和第N‑1帧差值图像每个像元的变化幅度进行高通滤波获得第n个固定图案噪声fn，根据第n个固定图案噪声fn对当前帧图像进行非均匀性校正，获得当前帧图像的校正结果；其中，N≥2，n≥2。本发明能够实现对由非均匀性引起的红外图像序列的固定图案噪声进行有效地去除。