本发明提供了自组装纳米材料及其制备方法与应用，所述纳米材料的原料包括核酸分子、氨基糖苷类分子和金属原卟啉；本发明所提供的自组装纳米材料，使用氨基糖苷类分子作为活化剂，与核酸分子及金属原卟啉共组装制备出的纳米材料，作为一种模拟酶催化剂，具有与天然辣根过氧化物酶相同数量级的底物转换数和催化效率，同时相比于氨基糖苷类分子与金属原卟啉、核酸金属原卟啉偶联物或核酸金属原卟啉自组装体，氨基糖苷类分子和核酸对金属原卟啉的催化活性有协同促进作用，具有更高的催化活性；在化学传感器和生物传感器中具有较高的应用价值。