基于第三代测序序列的补洞方法及装置

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摘要

本发明公开了一种基于第三代测序序列的补洞方法及装置。其中，该方法包括：对三代测序序列中包含的至少一个子测序序列进行比对，得到第一比对结果；从第一比对结果中提取位于至少一个gap序列一定范围内的子测序序列，得到至少一个第一提取结果；对第一提取结果进行精细比对，得到第二比对结果；从第二比对结果中提取位于至少一个gap序列一定范围内的子测序序列，得到至少一个第二提取结果；将至少一个第二提取结果进行组装，得到一致性序列；使用一致性序列替换基因组草图中的原有序列；其中，gap序列为未知序列。本发明解决了在对测序数据进行基因组补洞的过程中，比对测序序列的过程速度很慢，导致资源消耗较大的技术问题。

基本信息

专利标题：

基于第三代测序序列的补洞方法及装置

专利标题（英）：

暂无

公开（公告）号：

CN108763871A

申请号：

CN201810581026.8

公开（公告）日：

2018-11-06

申请日：

2018-06-05

授权号：

CN108763871B

授权日：

2022-05-31

发明人：

周义其李季张锦波蒋智李瑞强

申请人：

南京诺禾致源生物科技有限公司

申请人地址：

江苏省南京市高新开发区江北新区产业技术研创园浦滨路211号扬子科创中心一期A幢10楼

代理机构：

北京康信知识产权代理有限责任公司

代理人：

赵囡囡

优先权：

CN201810581026.8

主分类号：

G06F19/22

IPC分类号：

G06F19/22