测序数据排除细菌污染序列的方法和装置
公开
摘要
本发明提供了一种测序数据排除细菌污染序列的方法和装置。该方法包括：将测序数据与NT数据库进行比对，得到比对结果；将比对结果进行物种分类解析；去除比对结果中解析为细菌的序列，从而排除测序数据中细菌污染序列。通过将测序数据与NT数据库中的序列进行比对，将比对结果中的序列进行物种分类解析，将解析为细菌序列的测序序列去除，从而获得了排除细菌序列污染的测序数据。与现有技术中基于GC含量来排除细菌污染序列的方法相比，该方法不仅排除准确度更高，而且速度更快，更适合用于二代和三代大数据量的细菌污染排污。
基本信息
专利标题 ：
测序数据排除细菌污染序列的方法和装置
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114596917A
申请号 ：
CN202210501247.6
公开（公告）日 ：
2022-06-07
申请日 ：
2022-05-10
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
周勋赵勇王龙曹斌斌陶琳娜
申请人 ：
天津诺禾致源生物信息科技有限公司
申请人地址 ：
天津市武清区武清开发区创业总部基地B07
代理机构 ：
北京康信知识产权代理有限责任公司
代理人 ：
路秀丽
优先权 ：
CN202210501247.6
主分类号 ：
G16B30/10
IPC分类号 ：
G16B30/10
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B30/00
特别适用于对核酸或氨基酸进行序列分析的ICT
G16B30/10
序列排列；同源搜索
法律状态
2022-06-07 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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