本发明公开了一种基于capsule理论的青光眼医学影像分类方法，包括图像预处理操作、构建基于capsule的卷积神经网络和构建图像重构全连接网络；图像预处理操作首先利用已有的青光眼医学影像视盘检测模型裁剪出感兴趣区域以减少干扰信息，接着融合视盘和视杯语义分割图信息，最后采用限制对比度的自适应直方图增强，从而改善图像整体或局部对比度。基于capsule的卷积神经网络不仅能够自动学习青光眼医学影像特征，还能发现特征之间的位置与方向信息，从而更加准确地识别青光眼。图像重构全连接网络使用类别capsule恢复原始青光眼医学影像，目的是提高基于capsule的卷积神经网络的泛化能力。