一种基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法
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摘要
本发明提供一种基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法,所述方法包括:S1.构建接骨木转录组文库并测序,将测序结果进行拼接与组装成一个完整的转录组,取每条基因中最长的转录本作为Unigene,通过拼接得到混合Unigenes库;S2.对步骤S1中的混合Unigenes库进行SSR检测;S3.进行SSR引物设计,并鉴定SSR引物的多态性。本发明共设计出64148对SSR特异引物,通过试验优化方案得到了西洋接骨木荧光SSR‑PCR最优体系,在合成的100对荧光标记SSR引物中,有25对引物具有良好多态性。本发明基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法快捷、准确。
基本信息
专利标题 :
一种基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN108998561A
申请号 :
CN201811027099.9
公开(公告)日 :
2018-12-14
申请日 :
2018-09-04
授权号 :
CN108998561B
授权日 :
2022-05-03
发明人 :
姚俊修吴德军李善文燕丽萍王因花刘翠兰任飞李庆华
申请人 :
山东省林业科学研究院
申请人地址 :
山东省济南市文化东路42号
代理机构 :
济南圣达知识产权代理有限公司
代理人 :
郑平
优先权 :
CN201811027099.9
主分类号 :
C12Q1/6895
IPC分类号 :
C12Q1/6895 C12Q1/686 C12N15/11
IPC结构图谱
C
C部——化学;冶金
C12
生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程
C12Q
包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法;其所用的组合物或试纸;这种组合物的制备方法;在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制
C12Q1/64
•地质微生物试验,如用于石油
C12Q1/68
包括核酸
C12Q1/6876
用于核酸分析的核酸产品,如引物或探针
C12Q1/6888
用于生物体的检测与识别
C12Q1/6895
用于植物、真菌或藻类
法律状态
2022-05-03 :
授权
2019-01-08 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : C12Q 1/6895
申请日 : 20180904
申请日 : 20180904
2018-12-14 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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1、
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