本发明公开了一种内窥镜系统及判断导光部是否从主机拔除的方法，该系统包括镜体和主机，镜体内设置有第一光信号发射单元，第一光信号发射单元的输入端与镜体中的图像传感器的视频输出端连接；主机包括第一光信号接收单元和控制器,控制器通过检测第一光信号接收单元的输出信号是否异常来判断镜体中导光部与主机的连接状态，控制器的检测结果输出端与主机中的光源开关端和/或气泵开关端连接。该系统和方法不需要在主机出光口附近空间布设感应模块，也不受出光口附近高温的影响，在导光部与主机断开连接后，能够自动切断光源和/或气泵，避免对人眼伤害，以及延长光源和气泵的寿命，进而增加了整机的使用寿命，可靠性和安全性高。