本发明涉及基于小流域水生态环境保护阶段的河流类型划分方法，有效解决北方缺水型小流域可持续发展存在的复合型水资源短缺的问题，方法是，基于水生态环境保护阶段的河流类型划分边界范围，将干流、二级以上支流，及其他参与流域水循环的重要河流确定为参与类型划分的河流；基于流域全面监测确定河流类型划分的特征参数；基于特征参数分类的河流水生态环境保护阶段判定方法；基于水生态环境保护阶段的河段类型划分；对各河段水生态环境保护重要性进行分级。本发明为小尺度流域河流类型划分提供了新颖、严谨、简易、准确、实用的方法，为小流域精细化、精准化治理提供有效参考，经济和社会效益巨大。