本发明提供一种用于从岩石样本区域的图像中分析岩石的方法、计算机程序和系统，其包括访问数据库中所述样本区域的元素图，每个元素图包括像素阵列，并且每个像素具有能反映所述像素与化学元素的相关程度的值；访问数据库，所述数据库存储包括所述化学元素的多种化学元素的阈值；通过确定每个所述元素图中所述像素的值大于或小于相应的化学元素的阈值来确定物质在对应于所述像素的所述样本区域的一部分中的存在情况；基于所述像素中所述物质的存在情况标记所述像素；和输出数据，所述数据反映呈现在图形界面上的物质图。