本发明公开了一种燃料电池堆组装方法，具体步骤如下：S1：依次叠加电堆组件；S2：定位孔调整组件位置；S3：施加少量扭力，固定组件：将紧固螺帽螺纹连接固定在定位柱上，并施加少量的扭力，从而通过定位柱对电堆组件，即电堆下端板、下集流板、组堆单电池、上集流板和电堆上端板进行固定；S4：将电堆组件横放。本发明中，该燃料电池堆组装方法，在步骤S3施加少量扭力，固定组件后，通过步骤S4将电堆组件横放，然后采用横向组装，横向组装可使各个方向均衡施加压力，从而保证电堆各个位置受力均衡，使膜电极压缩量的一致，流阻分布更加均匀，有利于电堆的模拟和分析。