本发明公开了一种基于隐私保护的收入分配差距基尼系数度量方法，采用基于隐私保护的收入分配差距基尼系数度量系统；系统包括云端服务器CS、用户端CR、可信第三方机构TI、科研机构SRI；首先进行系统初始化，产生公钥和私钥数据，对私有数据加密，把加密后的私有数据发送到云端服务器，云端服务器对加密数据进行聚合、均值，利用经济学原理，计算基尼系数的密文数据，云端服务器将计算后的密文数据发送给科研机构，科研机构对密文数据进行解密，根据解密后的数据及基尼系数的定义计算基尼系数，最后科研机构得到n个人收入数据差距的基尼系数。本发明使得其他个人和机构在保证个人收入隐私的情况下，完成了个人收入分配差距基尼系数的度量。