本发明涉及一种高速数据通信总线自适应匹配方法，根据高速信号传输系统的特性把整个方法分为两个步骤：第一个步骤是底层链路参数重配置并对链路工作流程进行重置；第二步骤链路的链接关系进行重新握手交互；进而达到对通信系统的链路特性进行重置和配置，并且使新配置生效后的系统能快速的工作，可以彻底解决以前高速传输系统在运行过程中无法修改链路参数、运行状态无法形成稳定可动态配置的可靠运行状态的问题，从而达到系统运行状态可以动态配置，链路状态任意切换后、运行状态稳定可靠的效果，而且整个操作过程简易、操作周期短，构建可靠、连接速度快。