本发明公开了一种新生儿遗传病患病风险评估的装置。该装置包括：样本获取模块，用于获取新生儿出生后预定时间段内的DNA样本；测序模块，用于对DNA样本进行测序得到DNA数据；变异数据检测模块，用于DNA数据进行变异检测得到变异数据；注释模块，用于根据预定的注释人群频率数据库对变异数据进行注释，并对根据预定条件对注释进行过滤，得到过滤后的DNA注释数据；致病位点筛选模块，用于筛选出至少一类致病位点；以及风险评估模块，用于根据预定的原则对致病位点筛选模块中筛选出的至少一类致病位点进行风险评估。应用本发明的技术方案，可一次性对较多个基因涉及的不同种疾病进行分析，评估的准确性与易操作性得到提高。