本发明属于高压输配电领域，公开了GIS兼容性风险评估方法，能够对GIS兼容风险进行准确地预先评估，从而大大降低了扩建后整改耗费的时间、人力以及物力成本，首先，根据故障历史数据的涉及因素建立基础兼容风险指标、双母布设兼容风险指标、三相导体布设兼容风险指标、筒体兼容风险指标，母线对接兼容风险指标以及环境兼容风险指标；接着，根据涉及因素在故障历史数据的分布比例得到兼容风险评估指标对应的兼容风险权重；然后，根据涉及因素得到兼容风险评估指标的兼容风险评估值；最后，基于所有兼容风险评估指标的对应的兼容风险评估值和兼容风险权重得到兼容风险值，并根据兼容风险值对GIS非原厂扩建的兼容性风险进行评估。