本发明公开了一种疾病风险评估方法、装置及存储介质。疾病风险评估方法包括：接收疾病类型、疾病影响因素的待检测数据和待检测基因位点数据；根据预设赋值关系表分别对待检测数据和待检测基因位点数据进行赋值以得到对应的待检测分值，预设赋值关系表包括疾病影响因素的数据范围、基因位点数据和待检测分值的匹配信息；根据疾病类型和预设模型数据库确定目标疾病评估模型，预设模型数据库包括疾病类型和目标疾病评估模型的匹配信息，目标疾病评估模型通过多个训练样本数据对预设疾病评估模型进行训练得到；将待检测分值输入目标疾病评估模型得到疾病评估结果。本发明综合考虑基因位点和疾病影响因素来进行疾病评估，从而提高疾病评估的准确性。