本发明公开了一种基于多生物特征的身份验证系统，包括：通用身份验证系统框架，包括采用远程过程调用协议进行通信的服务端模块和客户端模块，当生物特征验证模块增加特征单元时，为特征单元的客户端模块和服务端模块的函数功能提供统一实现方式；生物特征验证模块，包括依据框架增加的两种以上的特征单元，每个特征单元通过不同生物特征进行身份验证；验证精度调整模块，通过设置生物特征验证模块的验证逻辑，调整系统的身份验证精度，包括基础精度、高精度和低精度。采用前述系统，能够在保证身份验证的准确率、安全性的前提下，根据需求灵活调整身份验证精度，提升了身份验证系统在增减生物特征用于身份验证时的灵活性。