本发明涉及冗余设备站的负荷管理领域，特别涉及一种基于DCS系统的冗余设备站自动寻优控制方法及系统；其中自动寻优控制方法包括建立冗余设备站的出力负荷平衡公式，并通过迭代学习特性回路以及学习剪枝特性回路完善出力负荷平衡公式，以实现冗余设备站自动寻优控制，既不需要额外耗费资金人力安排能效试验，也不需重规划设计冗余设备站，通过在DCS系统内采用部分可变编程语言模拟人工神经网络算法，搭建边缘计算回路，即可实时寻优整个设备站的主从负荷博弈策略，无需投入设备站改造成本，即能显著提高节能效益，并可实现全自动无干预一键切换，节约大量的隐性人力成本。