本实用新型公开了一种蛋白质测序分析器，包括分析器本体和设置在所述分析器本体上的分析试剂盒，所述分析试剂盒包括试剂盒本体、设置在所述试剂盒本体内的旋转机构、设置在所述旋转机构上的升降机构、放置在所述升降机构上的用于装试剂的多个试剂管和转动安装在所述试剂盒本体内的隔板，所述旋转机构可带动所述升降机构、多个所述试剂管和所述隔板同步转动，当所述升降机构带动所述试剂管上升时，多个所述试剂管均可穿过所述隔板。本实用新型的蛋白质测序分析器可以自动将相应的测序试剂送到取样工位，提高测序的效率，另外本分析试剂盒相对密封的空间设计可以减少试剂与外界接触而污染，从而在一定程度上提了高蛋白质测序的准确度。