本实用新型提供了一种冻干机系统装置，属于冻干技术领域，包括冻干消毒结构和排风系统，排风系统安装于冻干消毒结构的顶部，冻干消毒结构包括冻干机、真空泵、负压隔离器和过氧化氢灭菌器，真空泵安装于冻干机一侧并另一端固定连接与负压隔离器，过氧化氢灭菌器安装于负压隔离器的外侧并与外接电源电性连接。该装置中通过设置活性炭吸附层和电焚烧炉，活性炭吸附层对高效空气过滤器净化过的气体进行进一步的净化，使得内部有害物质能够更多的进行吸附，再由电焚烧炉对有害气体中的可燃气体进行燃烧，使得有害气体可以充分的得到净化达到排出标准，适用于冻干机系统装置的生产和使用。