本实用新型公开了一种药物制备用纯化水系统，包括原水预处理组件、纯化水制取组件和辅助组件，所述原水预处理组件包括通过管道依次连接的原水箱、第一水泵、初级过滤装置、加热装置、活性炭过滤器、加阻垢剂装置、保安过滤器，所述纯化水制取组件包括通过管道依次连接的一级高压泵、一级反渗透膜、EDI单元、中间水箱、二级高压泵、二级反渗透膜，所述一级高压泵的进水口与所述保安过滤器的出水口通过管道连接。有益效果：通过设置辅助组件，能够借助于短波紫外线照射分解水中的不易被活性炭吸附的小的有机化合物，如甲醇、乙醇等，使其转变成二氧化碳和水，以增加纯化水的纯度，从而降低TOC的指标。