本实用新型公开了一种黑臭水体旁路处理系统，它包括一号提升泵、细格栅、一体化涡轮循环往复污水处理设备、一体化磁混凝处理设备、一号中间水箱、二号提升泵、一体化曝气生物滤池、一体化清水池串联组成的处理系统，所述的一种黑臭水体的旁路处理系统还包括污泥处理系统、滤池反冲洗系统；所述的反冲洗系统出水及污泥处理系统的脱泥滤液通过二号中间水箱集中收集后再进入一体化涡轮循环往复污水处理设备进行处理。采用本实用新型，其出水水质指标可达地表类IV类水及以上标准，可解决高浓度进水水质或低温环境下系统出水难以达标问题，且能解决曝气生物滤池恢复周期长问题；能显著产生经济效益和环境效益，具有重大价值。