一种抽屉式微生物电池耦合人工湿地系统，包括装置本体和填料抽屉，填料抽屉由布满小孔的塑料板焊接而成；装置本体通过多块有机玻璃板焊接而成长方体形状，其四个侧面三个面密封，一个面敞开，装置本体底部设置有底封板，同时其底部和顶部均有进出水口，在底封板处设置有快速排水阀；装置本体内部从上而下每隔一段相同的距离都设置有一个布满小孔的隔板，填料抽屉放置在隔板上；装置本体的顶部设置有一个布满小孔的可拆卸式塑料筐；本方案很好的解决了填料的更换问题，可在不扰动其他填料的同时，更换某一层的填料，一方面便于填料的取样、更换和冲洗再利用，另一方面实现一套装置研究不同填料对湿地运行的影响，保证了湿地的长效运行。