本实用新型提供了一种操作部主轴及内窥镜操作部，属于内窥镜技术领域。它解决了现有内窥镜操作部中操作部主轴需要通过转接板才能固定到大底板上存在主轴与大底板的垂直度无法保证的问题。内窥镜操作部，包括壳体、固定在壳体内的大底板、固定在大底板上的护罩套以及主轴本体，主轴本体穿设在护罩套内，主轴本体上设有大轮组件和小轮组件，大底板上具有通孔，主轴本体的下端穿过通孔后通过连接法兰与大底板固连，护罩套与大底板之间设有用于使护罩套与主轴本体同轴的定位结构。本实用新型可有效保证主轴本体与大底板的垂直度，从而提高弯角手轮旋转的灵活顺畅性。