本实用新型公开了一种用于癌症细胞基因突变研究的的高通量基因测序装置，包括支撑台座、细胞测序驱动结构、测序自清洁结构、自清洁液体收集结构和测序室烘干结构，所述支撑台座的左上侧安装有连接铰链，且支撑台座的上方通过连接铰链与盖板之间铰接，所述盖板的右端面安装有把手，且盖板的内部设置有活动腔，所述细胞测序驱动结构安装于活动腔的内部。本实用新型通过设置的细胞测序驱动结构能方便为癌细胞的循环测量提供动力，并且步进电机的设置能使癌细胞组织液在测序结构的上方进行短暂的停留，以此能方便癌细胞组织液顺利的流淌到测序结构中，在细胞测序室内部安装的基因测序芯片能完成对癌细胞基因的测量。