本实用新型提供了一种船舶污水收集处理系统，沉淀池和清水池；其中，沉淀池的顶部开设有进水口，沉淀池的侧部形成有出水口，出水口布设有过滤装置，过滤装置包括框架结构、固设于出水口处的固定座、以及安装于框架结构内的过滤层，框架结构通过转轴转动安装于固定座上，转轴上套设有扭簧，用于将框架结构压抵于出水口边沿处，扭簧的第一端支抵于固定座，扭簧的第二端支抵于框架结构，沉淀池的位于出水口的上方布设有高压水枪，清水池连通于沉淀池。采用本实用新型中的船舶污水收集处理系统可以实现对污水的过滤，同时通过高压水枪对过滤层进行反向冲洗，延长了过滤装置的使用寿命，降低了污水处理成本。