本实用新型公开了一种酵素生产用高效分离系统，支撑板的中心处固定有固定柱，支撑板上方设置有混合箱，支撑板的两端上表面固定有弹簧，弹簧的顶端固定于混合箱的底部，支撑板的一端上方固定有电机，电机的输出轴伸入混合箱的底部并套固有转盘，支撑板的顶端通过设有的连接板固定有过滤箱，过滤箱的内部固定有导流板，导流板的下方固定有第一滤网架和第二滤网架，过滤箱的伸出端内部设置有渗透网。有益效果：通过在混合箱的内部设置有多个搅拌柱，并在混合箱的底部设置有电机、转盘和弹簧组合，用于带动混合箱左右晃动，便于将原料充分混合，避免损坏原料内部结构，利用渗透网的渗透功能，更加细化过滤效果，提高分离后酵素液的纯度。