本实用新型涉及一种蓄电池防亏电控制系统及车辆，控制系统包括电量检测模块、钥匙开关挡位检测模块、发动机运行状态检测模块、控制模块和控制信号执行模块，控制信号执行模块包括亏电告警单元和/或控制开关。当发动机没有运行、钥匙开关处于ACC/ON挡且蓄电池电量较小时，控制模块控制亏电告警单元以相应的形式进行亏电告警，及时提醒相关人员注意蓄电池有亏电的风险，以便采取相关的措施，和/或控制断开蓄电池与用电设备之间的供电线路，实现车辆的自动下电，防止蓄电池亏电。因此，该控制系统能够及时告知相关人员蓄电池的亏电状态，避免蓄电池的电量进一步降低，防止蓄电池亏电，避免影响发动机下次启动，提升车辆运行可靠性。