本实用新型公开了一种小型滤膜激光切割器及其使用的一种滤膜盘，其包括激光发生器，前面设有激光头和开关；工作台，工作台水平连接在激光发生器前面；滤膜承托机构，包括滤膜盘和盘托，盘托下面设有盘托轴，盘托轴安装在工作台上，滤膜盘放置在盘托上并位于激光头的下方；以及防护机构，包括保护筒、转盘和行程开关。使用该小型滤膜激光切割器切割滤膜时，整个过程利用激光切割，无需采用刀具或者剪刀进行人工切割，不仅简便高效，而且不会像器具接触滤膜导致滤膜产生位移而使切割不均匀，可避免固定装置和刀具与样品区的接触，进而有效避免样品缺损或污染。另外，防护机构的设置，可以确保激光不会误伤操作人员。