本实用新型提供了一种流动式电化学发光生物传感检测系统，所述系统包括流动注射进样单元、反应单元、磁分离单元和电化学发光检测单元；流动注射进样单元与所述反应单元连接，以将待检测样本溶液与包含检测探针的悬浊液混合后传输至反应单元，并在所述反应单元中进行充分反应得到反应后的混合液；磁分离单元将反应后的混合液中的磁珠与溶液分离，并将分离磁珠后的混合液传输至电化学发光检测单元进行检测，电化学发光生物传感器具有选择性高、响应时间短的优点，可实现微量目标物的测定，成本低廉，容易微型化和集成化的，通过电化学发光检测单元能够实现对待检测物质的快速检测，无需大型的检测设备且检测结果准确。