本实用新型公开了一种农用微生物的保藏装置，包括外储存罐，所述外储存罐的内部通过底部的隔热安装座固定安装有内罐体，所述内罐体外侧外储存罐的顶部通过螺纹结构安装有可拆卸环形盖，所述内罐体的顶部通过螺纹结构安装有可拆卸顶盖，所述可拆卸顶盖顶部的中央位置处设有透气凹槽，所述可拆卸顶盖内的中央位置处设有位于内罐体内的嵌入式封头。本实用新型采用储存罐与内罐体结合的方式，并在外储存罐与内罐体之间设置了可以用来方式降温冰块与隔热垫的空腔，使得保藏装置能够通过物理的方式保证保藏装置的保藏环境，且该装置在使用过程中并不需要使用到电子设备以及电能，使用更加环保，更加适用于短时间储存微生物。