一种多物理场耦合生物反应器，包括依次连通设置的生物反应罐体、超声波产生与控制装置、光照产生与控制装置和磁场产生与控制装置，磁场产生与控制装置与生物反应罐体连通设置；超声波产生与控制装置包括超声波发生器以及容器，超声波发生器的探头设置在容器内，容器外设置有第一冷却层；光照产生与控制装置包括第一玻璃管，第一玻璃管外设置有遮光套，遮光套的内壁设置有发光体；磁场产生与控制装置包括第二玻璃管，第二玻璃管外设置有电磁线圈。本实用新型可对不同微生物进行充分培养，对系统中各装置的腔体和管路均可实现单独灭菌，维护升级简便，也可与任意类型罐体连接，针对微生物不同培养需求，可自由组合使用，适用范围广。