本实用新型提供一种用于生产藻蓝蛋白多肽的冷冻干燥装置，包括：壳体，壳体限定出容纳空间；隔板，隔板将容纳空间分割为破壁室及干燥室，破壁室内设有若干个可拆卸连接的第一载料层；两套抽真空系统，抽真空系统分别与破壁室及干燥室连接，抽真空系统包括真空泵及真空传感器；两套冷冻系统，冷冻系统分别与破壁室及干燥室连接，冷冻系统对冷冻干燥装置进行降温；及两套升温系统，升温系统对冷冻干燥装置进行升温。本实用新型的有益效果在于：有两套真空冷冻干燥系统，同时实现生产中破壁及干燥步骤，省时省力；破壁时，可将物料展开后进行冷冻破壁，提高破壁效率及效果。