本实用新型公开了一种医院内镜清洗用水制备系统，包括自来水进水管，所述自来水进水管依次连接制水主机、分配系统和用水点；制水主机包括与自来水进水管出口依次连接的预处理器、增压泵和反渗透装置；分配系统包括与所述反渗透装置的出口依次连接的储水罐、输送泵、紫外杀菌器和微孔过滤器；用水点包括与微孔过滤器的出口并联连接的若干个取水阀，取水阀还连接有与储水罐连接的回流管，自来水经预处理器、反渗透装置、紫外杀菌器和微孔过滤器过滤杀菌消毒后得到的纯水远优于现有规范的要求，大大提高了医院内镜的清洗效果，延长医院内镜的使用寿命；多个取水阀方便同时取水，用不完的纯水还可回流至储水罐进行再循环，节约用水，降低用水成本。