本实用新型公开了一种配有玻璃金属封接法兰型原子气室，包括底座，所述底座的侧壁固定连接有玻璃套筒，且所述底座与玻璃套筒通过原子键合工艺进行连接，所述玻璃套筒远离底座的一端固定连接有过渡套筒，所述过渡套筒由可伐合金材料制成，所述过渡套筒远离玻璃套筒的一端固定连接有石英套筒，所述底座为圆形底座，且所述底座的侧壁沿其周向开设有多个安装孔，每个所述安装孔内均设有锁紧螺钉，所述底座的水平侧壁与竖直侧壁的交接处设有第一倒角。本实用新型通过将原子气室采用石英材料制成，并通过原子键合工艺加工，使得金属法兰与玻璃套筒固定连接在一起，即使在长期的使用过程中，也能保持良好的气密性，真空度高达10‑6次方。