本实用新型是一种防交叉污染的医用消毒设备，包括柜体，其特征在于，所述柜体的内部呈中空的长方体结构设置，所述柜体内的底部设有臭氧发生仓，所述储液箱内设有抽液泵，所述液体回收支管内安有阀门开关，所述液体回收主管的底部通过连接管连有废液回收箱，所述废液回收箱位于所述柜体的底部外侧。本实用新型结构科学合理，使用安全方便，通过设置分隔板，将柜体由上到下分为若干消毒腔，实现了将各类医疗器械投入到相应的消毒腔中分类消毒，避免了不同医疗器械之间的交叉污染，通过设置臭氧发生仓，以及安有喷液嘴的喷液盘，实现了臭氧和消毒液同时对医疗器械进行消毒，操作方便，避免了反复冲洗浸泡，进而提高了医用消毒设备的工作效率。