本发明公开了一种防止交叉污染的医用消毒设备，包括柜体和支撑板，柜体的中间设有放置筒，放置筒的下端中间设有通孔，放置筒的下端转动连接有连接板，连接板的中间设有限位连接机构，连接板的右侧固定连接有消毒机构，消毒机构的上端正对放置筒，放置筒的中间滑动连接有支撑架，支撑架上环形排列有连接口，连接口处固定连接有连接网，支撑架的下端环形排列有连接块，连接块和连接口交替设置，支撑板的上端固定连接有定位轴，定位轴的两侧都设有限位槽，定位轴和限位连接机构连接，本发明能在使用的时候将上侧的放置筒和下侧的放置筒之间进行密封隔绝，将各类医用器材投入到相应的放置筒内，避免在清洗的时候发生交叉污染。