本实用新型公开了一种动物粪便收集装置包括笼体、收集组件、收集笼和控温件，笼体的下端敞开设置，笼体被配置为容纳实验动物。收集组件位于笼体的下方，收集组件包括壳体、网体和过滤件，壳体的两端敞开设置，壳体的上端与笼体的下端对应设置，网体设在壳体内部，网体的上端面被配置为支撑实验动物，过滤件夹设在网体的周面和壳体之间，过滤件被配置为吸收实验动物的尿液，收集笼上与设有壳体下端对应设置的收集孔，控温件设在收集笼上，控温件被配置为控制收集笼的温度。该动物粪便收集装置能够将动物的尿液与粪便分离，并且能够将收集到的粪便保持在较低的温度，从而方便提取DNA和RNA。