本实用新型公开了一种肝素钠沉淀分离装置，包括罐体，所述罐体的顶部螺纹连接有盖体，所述盖体的内壁固接有橡胶筒，所述橡胶筒的外壁下方与罐体的内壁过盈配合，所述橡胶筒的内部设有搅拌杆，所述罐体的内壁间隙配合有基座。该肝素钠沉淀分离装置，通过基座、螺纹杆、螺纹管、罩体、盖体和搅拌叶之间的配合，使得该肝素钠沉淀分离装置便于对滤网和斜孔进行清理，进而避免了现有技术中，由于沉淀附着在滤网外壁，久而久之造成滤网堵塞的问题，保证了过滤效果和效率，且该肝素钠沉淀分离装置整体内部便于清理和消毒，因此可以避免细菌的滋生，对肝素钠的生产具有积极作用，该肝素钠沉淀分离装置结构简单，实用性强，适于推广使用。