本实用新型公开了一种肝素钠沉淀分离装置，包括沉淀分离罐、加料管和出料管，沉淀分离罐顶部设置有多个通孔，其中一个通孔与加料管的一端连通，另一个通孔内滑动设置有输液管，输液管的横向端底部与竖向设置的伸缩气缸的顶部连接，伸缩气缸设置在沉淀分离罐的一侧，输液管的另一端与水泵的一个开口连通，水泵的另一个开口内连接有出液管，出液管和储液箱的进液口连通，储液箱的底部设置有出液口，且出液口内连接有排液管，沉淀分离罐的底部设置有出料口，通过设置的输液管和伸缩气缸，方便根据透明观察板看到的废液高度，调整输液管的高度，再通过过滤网进行过滤，对罐内沉淀分离后的废水进行排出，避免了排液过程中造成肝素钠的损失。