本实用新型公开了一种微生物发酵氨水再除菌装置，包括过滤前氨水储罐、1.0um液体预过滤器、0.22um液体精过滤器、管路及阀门、0.22um氨水再除菌过滤器11和发酵罐，过滤前氨水储罐通过氨水输出管与1.0um液体预过滤器和0.22um液体精过滤器相串联，串联后的氨水输出管设有多个分支，每个分支连接到一个发酵罐，每个连接至发酵罐的氨水输出管的分支上均设有0.22um氨水再除菌过滤器，0.22um氨水再除菌过滤器前端设有截止阀，后端设有自控隔膜阀和手动隔膜阀，本实用新型能对于单个发酵罐可以做到每一批次对0.22um氨水再除菌过滤器进行灭菌，既能提高氨水无菌过滤效果，又能不影响其他发酵罐使用的氨水。