本实用新型涉及菌种培育箱技术领域，尤其是一种生物制药用菌种培育箱，包括箱体，箱体的底部的四角均固定安装有万向轮，箱体的外侧通过铰链转动连接有箱门，箱体的内部安装有发酵罐，箱体的顶部安装有搅拌电机，搅拌电机的输出轴连接有搅拌轴，搅拌轴的侧壁上安装有若干叶片组件，箱体一端的侧壁上安装有进口管，进口管的出口端通过导管连接有若干菌种导入支管，箱体另一端的侧壁上固定安装有出口管，出口管的进口端通过导管固定连接有若干菌种导出支管，菌种导出支管均固定安装在箱体的内部，且与发酵罐的内部相通。本实用新型能够大大提高菌种的成活率，实用性强。