本实用新型公开一种磁悬浮穿梭系统，该磁悬浮穿梭系统包括金属感应板和悬浮运行于金属感应板上的磁悬浮穿梭装置，磁悬浮穿梭装置包括：机架、悬浮引擎、驱动机构、驱动机构以及限位导向件，永磁转盘安装于电机的转子上，电机的转子驱动永磁转盘旋转，以使永磁转盘和金属感应板之间产生磁斥力，而将机架悬浮于金属感应板上方；驱动机构设于机架上，驱动机构用于驱动机架相对金属感应板水平移动；限位导向件安装于机架的下侧；金属感应板具有限位导向槽，限位导向件滑动安装于限位导向槽。本实用新型技术方案减小了金属感应板对磁悬浮穿梭装置的摩擦阻力，有利于改善磁悬浮穿梭装置的运行速度。