本实用新型提供了一种带混合结构的磁珠分离和清洗装置，包括安装部件、磁珠吸附装置，以及设置在安装部件上的从下到上依次布置的清洗盘部件、混匀装置和针组件，清洗盘部件包括被驱动旋转的环形的清洗盘和安装在清洗盘上的多个反应杯，针组件包括升降针架和安装在升降针架上的多个针，混匀装置包括混匀板和垂直安装在混匀板上的多个混匀组件，针垂直穿过混匀板和/或混匀组件后进入反应杯，混匀组件包括混匀棒，混匀棒中心轴和反应杯中心轴平行且位于反应杯外部，混匀棒一端设有凸起，混匀棒被驱动旋转，带动凸起间隔的抵靠和拖动反应杯。本实用新型的目的是提供一使反应液混匀充分、混匀结构简单可靠的带混合结构的磁珠分离和清洗装置。