本实用新型公开了一种生物蛋白加工用搅拌机构，包括底座，所述底座的下端中部固定安装有转动电机，所述转动电机的电机轴贯穿于底座置于底座的上侧，所述电机轴的上端固定安装有工字型架。本实用新型通过转动电机、工字型架、放置孔、试管、固定板、螺纹杆、螺母和遮挡罩的设置，将装有生物蛋白的试管放入放置孔内，然后将固定板向下移动将密封塞置于试管口内，然后拧动螺母将固定板进行固定，进一步的将试管固定在工字型架上，然后将遮挡罩对工字型架进行保护，然后启动转动电机从而带动工字型架转动，进一步的带动试管内的生物蛋白做离心运动从而能够对试管内的生物蛋白进行混合搅拌，从而防止了搅拌叶片对生物蛋白造成破坏。