本实用新型公开了一种新型高通量测序系统，包括车体和隔板，隔板内设有推拉门和百叶窗，车体包括采血区、测序区和驾驶区，采血区和驾驶区设置在隔板一侧，采血区内设有采血工作台，测序区设置在隔板另一侧；测序区内设有超净工作台、高通量测序装置、血液储存冰箱、待测样品处理工作台和试剂存储冰箱。本实用新型可以根据需求到需要测序的地方进行高通量测序工作，有效扩大工作范围，能够覆盖更多的人群，尤其适用于偏远地区人的高通量测序。