本实用新型公开了一种加菌翻料机构及有机肥翻料机，加菌翻料机构包括加菌装置、及设置在其下方的翻料装置。加菌装置包括：料斗，其顶部设菌剂入口，底部设菌剂出口I；螺旋输送装置，其管体与料斗的菌剂出口I连接并贯通，其一端为菌剂出口II，管道用于从菌剂出口I处接收菌剂、并将其从菌剂出口II输出。翻料装置包括两个喂料轮，通过其自身的旋转可以向两个喂料轮的中间收集物料，物料为有机肥及加菌装置输出的菌剂；主翻料轮，用于接收从两个喂料轮输送来的物料，并通过其自转来对收集到的物料进行粉碎和翻抛，再从其左侧或右侧出料。解决了现有翻抛设备结构复杂、机动性差、成本高的问题。