本实用新型公开了一种生物有机肥在线定量加菌装置，包括箱体，所述箱体内安装有电动伸缩杆，所述电动伸缩杆的上方设置有电子秤，所述电子秤右侧下方设置有导流板，所述导流板下方设置有第一搅拌轴，所述第一搅拌轴下方设置有第二搅拌轴，第一搅拌轴上安装有从动轮，第二搅拌轴上安装有主动轮，所述主动轮通过传送带传动连接从动轮，所述第二搅拌轴由旋转电机驱动，第一搅拌轴上设置有第一搅拌桨叶，第二搅拌轴上设置有第二搅拌桨叶，本实用新型通过电子秤称量菌料，便于对菌料的量精准掌握，所述旋转电机带动第一搅拌桨叶和第二搅拌桨叶同时旋转，第一搅拌桨叶可以将菌料打散，第二搅拌桨叶对有机肥和菌料实现快速混合。