本实用新型提供了一种生物有机肥发酵自动加菌设备，包括支架、安装在支架顶部的丝杠滑动机构和安装在丝杠滑动机构上的圆柱体菌料容器，所述菌料容器可在所述丝杠滑动机构的作用下水平移动；所述菌料容器侧壁上分别设有加料口和槽口；所述菌料容器底壁上设有多个出料孔一；所述菌料容器内紧靠所述底壁处活动连接有圆形挡板，所述圆形挡板上设有与所述出料孔一尺寸、数量、布局均相同的出料孔二，所述圆形挡板上设有推片，所述推片上设有限位块，所述限位块卡在所述槽口内，当通过限位块拨动所述推片，所述圆形挡板发生转动，从而使所述出料孔一和所述出料孔二对齐或者不对齐。本实用新型可以实现在发酵床上均匀喷洒菌剂，提高工作效率和除臭效果。