本申请涉及体外诊断领域，具体是涉及一种用于流式荧光分析的专用光学系统，包括第一激光器、第一反射镜架、双胶合透镜、流动室、第一二向色镜和第一分类通道和检测通道，第一反射镜架位于第一激光器和第一透镜之间，且与第一激光器和第一透镜之间的光路为直角，第一透镜与第一二向色镜之间依次为流动室和非球面聚焦透镜，所述第一二向色镜旁分别为第一分类通道和检测通道。本申请针对流式荧光的特点对光路系统进行了大幅简化，采用了标准光学镜片、流动室、低成本探测器等，因此具有结构简单、光学元件少、调试方便、系统可靠、模块化、可根据客户需求进行多种组合等特点。可作为常规产品大量推广，让高科技产品进入基层医院成为可能。