本实用新型涉及食品检测技术领域，具体涉及一种样品开检测孔装置及样品自动化检测系统。所述样品开检测孔装置包括样品输送机构，包括输送轨道，以及用于将若干样品推入输送轨道的第一机械臂；样品开孔机构，包括临近输送轨道设置的刀片，刀片的延伸方向与输送轨道的延伸方向呈角度设置，并形成朝向样品入口的方向开口大，朝向样品出口的方向开口小的喇叭形通道；其中，在样品开检测孔时，样品在第一机械臂的推动下进入喇叭形通道，并由刀片划破，整个流程由于无需检测人员手持锋利刀具开孔，提升了检测人员操作的安全性，降低了检测人员的劳动强度。